研究目的
探究掺铒钇铝石榴石(Er:YAG)激光与环孢素A(CsA)对人牙龈成纤维细胞(HGFs)的分子影响,以改进牙周病治疗。
研究成果
结果表明,两种治疗方法分别对应两套独立的生物标志物组合,提示针对患者治疗可能存在多种治疗方案。联合应用这两种方法可能是该领域的一种有效手段,但关于二者协同效应仍需进一步研究。
研究不足
该研究的局限性在于所采用的蛋白质组学技术的灵敏度,由于用于激光数据的方法更为灵敏,因此与药物效应相比,鉴定出的与激光效应相关的蛋白数量更多。
1:实验设计与方法选择:
聚焦于研究激光照射及环孢素A处理后人牙龈成纤维细胞蛋白质组谱的文章。使用Cytoscape 3.4.0软件分析差异表达蛋白的拓扑特征,并通过Cluster ONE插件从蛋白质互作网络中筛选???。
2:0软件分析差异表达蛋白的拓扑特征,并通过Cluster ONE插件从蛋白质互作网络中筛选??椤? 样本选择与数据来源:
2. 样本选择与数据来源:通过PubMed数据库检索关键词"牙龈成纤维细胞"、"蛋白质组学"、"药物"和"激光治疗"的文献。纳入以人类牙龈组织样本为研究对象,且比较药物或激光处理组与未处理组HGF组织的研究。
3:实验设备与材料清单:
Cytoscape 3.4.0软件、Cluster ONE插件、PubMed数据库。
4:0软件、Cluster ONE插件、PubMed数据库。 实验流程与操作步骤:
4. 实验流程与操作步骤:基于节点度、介数中心性等拓扑参数分析蛋白质互作网络,对密集连接区域及关键蛋白进行GO富集分析。
5:数据分析方法:
采用Cytoscape进行网络可视化与分析,Cluster ONE筛选???,ClueGO进行GO富集分析。
独家科研数据包,助您复现前沿成果,加速创新突破
获取完整内容-
Er:YAG laser
Used for periodontal therapy to remove subgingival biofilms from periodontal pockets and to induce proliferation in human gingival fibroblasts.
-
Cyclosporin A
Used as an immunosuppressive drug to treat autoimmune diseases and to prevent organ transplant rejection, with effects on human gingival fibroblasts.
-
Cytoscape
Version 3.4.0
Software environment for integrated models of biomolecular interaction networks, used for PPI network analysis.
-
Cluster ONE
A plug-in for Cytoscape used to cluster the whole network for identification of densely connected region(s).
-
ClueGO
Application of Cytoscape used for GO enrichment analysis.
-
登录查看剩余3件设备及参数对照表
查看全部