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小鼠胚胎软骨和骨组织的激光捕获显微切割用于基因表达分析

DOI:10.3791/60503 期刊:Journal of Visualized Experiments 出版年份:2019 更新时间:2025-09-16 10:30:52
摘要: 激光捕获显微切割技术(LCM)是从异质性组织中分离特定细胞类型或目标区域的有力工具。骨骼成分的细胞与分子复杂性随发育过程而增加。组织异质性(如软骨与骨成分之间、或它们与周围组织交界处)是研究发育中软骨与骨骼的障碍之一。本方案提供了一种快速的组织处理与分离方法,能获得适用于基因表达分析的高质量RNA。通过冷冻小鼠胚胎组织切片,并采用短暂甲酚紫染色使软骨与骨呈现区别于周围组织的颜色,随后快速脱水并通过LCM分离软骨与骨。该过程中最大限度减少水溶液接触以维持RNA完整性。成功采集了E16.5小鼠梅克尔软骨与下颌骨,基因表达分析显示成骨细胞、骨细胞、破骨细胞及软骨细胞的标志基因存在差异表达。该方法还能从多种组织及不同胚胎发育阶段获取高质量RNA。本方案详述了LCM样本制备流程,包括新鲜冷冻组织的冰冻包埋、切片、染色与脱水,以及通过LCM精准分离软骨与骨以获得适用于转录组分析的高质量RNA。
作者: Meng Wu,Divya Kriti,Harm van Bakel,Ethylin Wang Jabs,Greg Holmes
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研究概述 实验方案 设备清单

研究利用激光捕获显微切割技术(LCM)从异质性组织(特别是小鼠胚胎软骨和骨骼)中分离特定细胞类型或目标区域,以进行基因表达分析。

该方案为软骨和骨组织的激光捕获显微切割(LCM)提供了一种优化方法,能保持RNA的高完整性,便于后续进行RNA测序分析。该方法已成功应用于不同发育阶段软骨和骨组织的LCM,用于基因表达分析。

所使用的LCM系统无法直接切割矿化组织,因此需要解剖整个骨区域。经显微解剖的骨化区域并不均质,包含多个亚群。

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