研究目的
开发首个软件工具箱,利用强大的生物分子成分分析(BCA)算法对细胞内拉曼光谱进行即时分析,以精确解析主要细胞器中的分子组成。
研究成果
BCAbox软件可用于主要细胞器中分子成分的即时分析,并能适配多种市售拉曼显微镜,有助于推动生物医学应用中拉曼分析技术的进一步发展与标准化。
研究不足
BCAbox针对特定硬件进行了调校,需要进行细致的强度校准和额外的样品制备工作。若要将其整合到拉曼成像软件中以扩展功能,可能还需要进行修改。
1:实验设计与方法选择
本研究开发了一款独立的BCAbox软件,用于细胞器原位生物分子组分分析,并与商用共聚焦拉曼显微镜集成。
2:样本选择与数据来源
使用常规玻璃底培养皿中生长的HeLa细胞,通过商用荧光报告分子标记细胞器以实现靶向拉曼光谱采集。
3:实验设备与材料清单
DXR2拉曼共聚焦显微镜、633nm@70mW激光二极管??椤⒂庹彰髌?、Plan N 100×油镜及多种校准用生化溶液。
4:实验流程与操作步骤
采集HeLa细胞不同细胞器的拉曼光谱,并应用BCAbox软件进行分析。实验在活细胞和固定细胞中均开展测量。
5:数据分析方法
BCA工具箱包含背景处理与扣除、非线性最小二乘拟合程序以及用于拉曼光谱分析的图形用户界面。
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获取完整内容-
DXR2 Raman confocal microscope
DXR2
Thermo Fisher Scientific
Used for acquiring Raman spectra of different organelles in HeLa cells.
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Plan N oil immersion objective
Plan N 100×
Olympus
Used for Raman spectra acquisition to be compatible with BCA.
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Laser Diode module
ROUSB-633-PLR-70-1
Ondax
Produces excitation power at the sample for Raman spectra acquisition.
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Fluorescence Illuminator
Installed for visualization of labelled cellular organelles.
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