研究目的
研究多细胞生物中时空基因表达的自动化追踪方法，无需依赖荧光标记的细胞壁或细胞核。
研究成果
所提出的流程为量化运动或生长样本中的生物基因表达数据提供了一种工具，无需对细胞壁或细胞核进行荧光染色。该方法可应用于其他生长或运动的生物体，通过将额外的荧光通道用于基因标记而非细胞壁染色，从而提高实验通量。
研究不足
该方法假设植物根部的横截面形状为圆形，但这一假设可能并不适用于所有样本。此外，坐标系创建方法的准确性仅通过有限数量的基准实验进行了验证。
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[IEEE 2018年第40届医学与生物工程学会国际年会(EMBC) - 美国夏威夷檀香山(2018年7月18日-21日)] 2018年第40届IEEE医学与生物工程学会国际年会(EMBC) - 通过光片显微镜和计算机视觉技术在活体生物中追踪基因表达
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[IEEE 2018年第40届医学与生物工程学会国际年会(EMBC) - 美国夏威夷檀香山(2018年7月18日-21日)] 2018年第40届IEEE医学与生物工程学会国际年会(EMBC) - 通过光片显微镜和计算机视觉技术在活体生物中追踪基因表达
DOI：10.1109/EMBC.2018.8512416
出版年份：2018
更新时间：2025-09-09 09:28:46
摘要：
利用活体显微镜图像对时空基因表达进行自动追踪，为理解多细胞生物的发育过程提供了重要见解。现有分析工具大多依赖细胞壁或细胞核定位蛋白的荧光标记来评估生物体的位置、方向和整体形态——这些信息对于确定基因表达活动的位置至关重要。特别是在植物研究中，具有荧光标记的生物体品系可能需要数月培育，既耗时又昂贵。我们提出了一种无需荧光标记细胞壁或细胞核的自动化解决方案来分析基因表达的空间特征。该方案通过光片显微镜的荧光成像通道指示、分割和追踪基因表达，同时利用明?。ǚ怯猓┏上裢ǖ廊范ㄉ锾迥诨虮泶锏奈恢?。我们以拟南芥根系图像为概念验证案例，通过研究热休克胁迫对CYCLIN B1蛋白产生的影响来验证本方案。
作者：
Eli Buckner，Chanae Ottley，Cranos Williams，Angels de Luis Balaguer，Charles E. Melvin，Rosangela Sozzani
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