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基于氧化石墨烯淬灭的荧光原位杂交技术(G-FISH)用于组织中RNA检测:简单快速的RNA组织诊断方法

DOI:10.1016/j.nano.2018.12.004 期刊:Nanomedicine: Nanotechnology, Biology and Medicine 出版年份:2018 更新时间:2025-09-23 15:23:52
摘要: 基于石蜡包埋组织的荧光原位杂交(FISH)RNA检测具有挑战性,其复杂流程常导致结果不确定且图像质量不佳。本研究开发了一种基于氧化石墨烯(GO)荧光淬灭与恢复的稳健RNA检测方法——甲醛固定石蜡包埋(FFPE)组织G-FISH技术。通过将荧光标记肽核酸(PNA)连接至GO,我们分别在小鼠正常脑组织胞质中检测到内源性长链非编码RNA BC1,在原代培养海马神经元中检测到组成型蛋白β-肌动蛋白mRNA,在阿尔茨海默病模型小鼠脑组织中检测到miR-124a,在多形性胶质母细胞瘤组织中检测到miR-21。该技术可检测脱蜡FFPE组织、冷冻组织及透明脂质交换解剖刚性成像/免疫染色兼容组织水凝胶(CLARITY)透明脑组织中的编码与非编码RNA(无论长短)。G-FISH恢复的荧光强度与定量实时RT-PCR测定的miR-21含量高度相关。我们认为G-FISH是一种简单、快速、经济且灵敏的RNA检测方法,背景极低,适用于多种研究和诊断用途。
作者: Do Won Hwang,Yoo Ri Choi,Dohyun Kim,Hye Yoon Park,Kyu Wan Kim,Mee Young Kim,Chul-Kee Park,Dong Soo Lee
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开发一种基于氧化石墨烯荧光淬灭与恢复的原位杂交技术(G-FISH),用于福尔马林固定石蜡包埋组织中简单快速的RNA原位检测。

G-FISH是一种简单、快速、廉价且灵敏的组织RNA检测方法,背景极低。该方法可检测福尔马林固定石蜡包埋组织(FFPE)、冷冻组织及CLARITY透明化组织中的多种RNA,在阿尔茨海默病和胶质母细胞瘤等疾病的诊断与研究领域展现出应用潜力。未来工作可着眼于提高分辨率并扩展至其他RNA类型。

由于信号开关策略,G-FISH可能无法达到单RNA分子分辨率。G-FISH与qPCR在miR-21检测上的相关性中等(R2=0.739),可能是局部测量与整体组织测量存在差异所致。

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