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用于开发mRNA帽结合蛋白结合活性与水解活性检测的荧光开启探针

DOI:10.1002/chem.201900051 期刊:Chemistry - A European Journal 出版年份:2019 更新时间:2025-11-14 15:32:45
摘要: m7G帽是所有真核生物mRNA 5'端独特的核苷酸结构。该帽结构与多种细胞蛋白特异性相互作用,参与对细胞生长和功能至关重要的生物过程。为研究重要帽识别蛋白,我们通过末端磷酸(酯)基团合成了带荧光标记的m7G核苷酸,并探究其结合蛋白或酶切时发射特性的变化。仅芘标记化合物表现出灵敏的"点亮型"探针特性:芘标记的m7GTP类似物与真核翻译起始因子4E(eIF4E)结合时荧光增强达8倍,被脱帽清除酶(DcpS)切割时增强超过30倍。这些发现为开发结合活性及水解活性检测方法奠定了基础。通过已表征的eIF4E配体库和DcpS抑制剂库验证了检测方法的实用性。该DcpS检测法还用于研究HeLa和HEK细胞胞质提取物中内源酶的水解活性及抑制作用。
作者: Renata Kasprzyk,Beata J. Starek,Sylwia Ciechanowicz,Dorota Kubacka,Joanna Kowalska,Jacek Jemielity
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研究概述 实验方案 设备清单

开发发现和评估m7G帽结合蛋白抑制剂的新方法,这些方法比现有方法更直接、耗时更少且劳动强度更低,使用荧光标记的单核苷酸帽类似物作为eIF4E和DcpS等蛋白的开启型探针。

芘标记的m7G核苷酸可作为有效的开启型探针,用于开发针对eIF4E和DcpS等帽结合蛋白的高灵敏度FLINT检测方法。这些检测适用于高通量筛选,与文献数据具有良好相关性,可用于研究细胞裂解液等复杂生物混合物中的酶活性。未来工作应聚焦于优化探针结构以实现更广适用性和可见光范围发射,从而减少干扰。

芘标记探针的近紫外区发射可能受到荧光抑制剂的干扰,需进行背景扣除。对于弱结合配体或强亲和力结合物,准确测定亲和力可能具有挑战性,此时可能需要使用更高亲和力或不同发射特性的探针。该方法并非适用于所有类型抑制剂,尤其是那些在紫外区具有强固有荧光的抑制剂。

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