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SMoLR:R语言中单分子定位显微镜数据的可视化与分析工具
摘要: 背景:单分子定位显微镜是一种超分辨率显微技术,可在生物样本中实现纳米级精度的蛋白质定位与组织结构测定。要实现数据的生物学解读,必须从超分辨率数据集中提取定量信息。由于这些数据集具有复杂性和海量性,需要灵活且用户友好的软件工具。 结果:我们开发了SMoLR(R语言单分子定位分析框架)——一个基于R编程环境的灵活分析平台,用于探索和分析单分子定位数据。该软件包专门用于从单分子显微镜获取的定位数据中提取、可视化和分析定量信息。SMoLR不仅能可视化纳米级亚细胞结构,还能提供分子分布与定位的统计信息,既可处理单张图像,也可批量分析大量超分辨率图像集。此外,我们还描述了一种基于图像特征的粒子平均分析方法,通过SMoLR识别纳米结构中的共同特征。 结论:依托强大的R编程环境,SMoLR使科学家能够通过提取和可视化定量信息来研究细胞内生物分子的纳米级组织结构,从而在单分子层面揭示多种生物过程的内在机制。
关键词: 图像分析、图像定量、超分辨率、显微镜技术、R语言、单分子定位
更新于2025-09-23 15:22:29