研究目的
研究转录因子bZIP68通过其氧化还原敏感机制在拟南芥中平衡胁迫耐受性与生长的作用。
研究成果
该研究表明,bZIP68在拟南芥中平衡胁迫耐受性与生长方面发挥关键作用。作为氧化还原敏感的转录因子,它在正常条件下抑制胁迫耐受基因并促进生长相关基因的表达。当受到氧化胁迫时,bZIP68发生氧化反应,导致其失活和/或易位至细胞质,从而增强胁迫耐受性但抑制生长。
研究不足
该研究主要聚焦于拟南芥,其发现可能并不直接适用于其他植物物种。核内活性氧的产生机制以及bZIP68在核质穿梭中的确切作用仍不明确。
1:实验设计与方法选择:
本研究采用拟南芥bZIP68基因的T-DNA插入突变体,通过原生质体瞬时表达实验、全基因组bZIP68结合位点分析(ChIP-seq)以及转录组分析(RNA-seq)开展研究。
2:样本选择与数据来源:
使用拟南芥幼苗和原生质体。bzip68-1和bzip68-2突变体材料来自拟南芥生物资源中心。
3:实验设备与材料清单:
共聚焦显微镜(徕卡TCS SP5 II)、用于RNA-seq的Illumina HiSeq 2500系统及用于ChIP-seq的Illumina HiSeq1500平台。
4:实验流程与操作步骤:
包含转基因品系构建、多条件表型分析、亚细胞定位研究、ChIP-seq与RNA-seq数据分析,以及DNA-蛋白质相互作用研究的EMSA实验。
5:数据分析方法:
RNA-seq数据采用TopHat 2.1.0和DESeq2分析;ChIP-seq数据通过MACS-1.4.3处理并结合HOMER进行基序发现分析。
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