研究目的
通过应用色调-饱和度-亮度色彩空间来简化图像细胞计量学中的表面创建流程,从而实现对多参数荧光显微镜图像更高效、灵活的分析。
研究成果
HSB表面创建工作流显著简化了图像细胞术中的表面创建过程,为分析多参数荧光显微镜图像提供了更高效、更灵活的方法。该方案适用于多种成像模式和数据集,在定量分析方面有所改进,使生物学家能从成像数据中获取更多信息。
研究不足
HSB表面创建工作流仅限于向HSB转换算法输入三个通道,若图像中使用了超过三个标记物,这可能会成为问题。需要战略性地规划多重染色组合,以选择相关的共定位标记物输入算法。
1:实验设计与方法选择:
本研究采用色相-饱和度-亮度(HSB)色彩空间模型简化图像细胞术中的表面创建流程,通过将多通道荧光图像转换为HSB通道进行表面构建。
2:样本选择与数据来源:
研究使用小鼠耳部针刺损伤模型的静态与动态成像数据集,包括免疫染色的全层耳部皮肤及多种荧光标记组合的脾细胞。
3:实验设备与材料清单:
设备包含Olympus倒置FV1000共聚焦显微镜和LaVision TriM Scope II显微镜;材料包括用于染色的各类荧光标记物与抗体。
4:实验流程与操作步骤:
工作流程涵盖图像采集、HSB通道转换、Imaris软件表面创建及FlowJo统计分析。
5:数据分析方法:
包括光谱补偿、Imaris中的统计提取与表面可视化,通过组织细胞术定义细胞亚群。
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Olympus inverted FV1000 confocal microscope
FV1000
Olympus
Image acquisition for fluorescence microscopy
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LaVision TriM Scope II microscope
TriM Scope II
LaVision BioTec
Multiphoton imaging
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8.4
Bitplane
Cell surface creation and visualization
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FlowJo
v.10.1
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Flow cytometry-style analysis
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