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射流冷却吡咯-环戊酮二元团簇的红外腔衰荡光谱与密度泛函理论研究:假旋转对N-H···O=C氢键的影响

DOI:10.1021/acs.jpca.0c00794 期刊:The Journal of Physical Chemistry A 出版年份:2020 更新时间:2025-09-19 17:13:59
摘要: N-H…O=C氢键(H键)的几何结构与能量特性对于理解蛋白质和DNA等生物分子的稳定性与柔性至关重要。喷流冷却的吡咯-环戊酮(Py-Cp)二元团簇是从微观角度研究N-H…O=C氢键的理想模型。本研究通过红外腔衰荡光谱观测了Py-Cp二元团簇的NH伸缩振动。密度泛函理论计算进一步揭示了不同尺寸二元团簇的几何结构、简谐振动、分子间能量及供体-受体相互作用。在氦缓冲气体中通过调节吡咯与环戊酮的蒸气压进行超声膨胀,测定了Py-Cp二元团簇的红外光谱。IR谱带强度随蒸气压的变化为NH伸缩振动提供了振动指认,Py1-Cp1、Py1-Cp2和Py2-Cp1的计算频率成功复现了这些特征。通过向氦缓冲气体中掺入氩气进行超声膨胀,还制备了Py1-Cp2团簇以区分环戊酮分子伪旋转导致的异构体NH伸缩振动。Py1-Cp1通过N-H…O=C氢键形成;Py1-Cp2具有由N-H…O=C氢键及吡咯与两个环戊酮分子间堆叠作用构成的环状结构;Py2-Cp1同样呈环状结构,不仅包含N-H…O=C氢键,还存在两个吡咯分子间的N-H…π氢键及吡咯-环戊酮堆叠作用。对比Py2-Cp1与相应吡咯-丙酮二元团簇的氢键几何结构发现,吡咯与环戊酮间的堆叠作用通过协同效应增强了N-H…O=C和N-H…π氢键。
作者: Yoshiteru Matsumoto,Kenji Honma
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研究概述 实验方案 设备清单

研究喷气冷却吡咯-环戊酮二元团簇中N-H…O=C氢键的几何结构与能量学,从微观角度理解生物分子的稳定性与柔性。

该研究成功确定了Py-Cp二元团簇的结构和振动频率,揭示了N-H…O=C氢键的柔韧性与强度。研究发现Py与Cp之间的堆叠作用通过协同效应增强了氢键,为理解与生物分子稳定性相关的微观相互作用提供了见解。

该研究受限于某些频率范围内的信噪比,这可能会掩盖部分振动谱带。此外,由于Cp伪旋转导致的异构体结构复杂性增加了振动分析的难度。

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