研究目的
开发一种无标记、无酶的DNA计算器,用于灵敏便捷地测定ATP浓度。
研究成果
这种基于无标记荧光且无需酶的AND逻辑DNA计算器对ATP检测具有高度灵敏性和选择性,在临床诊断及其他小分子和蛋白质的检测中具有潜在应用价值。
研究不足
该方法灵敏度和选择性高,但线性范围仅限于50-500 nmol/L。除人尿和血清外,尚未在更广泛的真实样本中进行测试。
1:实验设计与方法选择:
该检测利用PicoGreen和金纳米颗粒(GNPs)的特性。与结合单链DNA(ssDNA)相比,PicoGreen结合双链DNA(dsDNA)时会形成高荧光复合物。在特定离子强度下,ssDNA和具有粘性末端的dsDNA可吸附于GNPs表面,使能量从DNA转移到GNPs从而有效淬灭荧光强度。但完全互补的dsDNA因在该离子强度下不结合而从GNPs释放,此时可观察到PicoGreen荧光。
2:样本选择与数据来源:
输入为ATP和DNA-M' ssDNA,输出为PicoGreen的荧光信号。
3:实验设备与材料清单:
PicoGreen染料、金纳米颗粒(GNPs)、寡核苷酸、缓冲溶液。
4:实验步骤与操作流程:
ATP和DNA-M'的存在触发探针结构从DNA-T + DNA-M dsDNA转变为DNA-M + DNA-M' dsDNA,并引起PicoGreen荧光强度变化。
5:数据分析方法:
在480 nm激发波长和495-700 nm检测范围内获取荧光光谱。
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Fluorescence Spectrometer
RF-6000
Shimadzu
Used to measure the fluorescence spectra and reaction progress.
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PicoGreen
Shanghai Yi Sheng Technology Co., Ltd.
Fluorescence dye used as signal transducer in the DNA calculator.
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Gold Nanoparticles
Lianshi Mall
Used as quenchers to suppress the background signal and enhance the sensor's sensitivity.
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