研究目的
改进现有的FLIM/FRET方法,用于监测单活细胞中Nrf2与Keap1的相互作用,以提高通量、精度并降低细胞间变异性。
研究成果
改进的FLIM/FRET方法成功提高了活细胞中Nrf2-Keap1相互作用测量的通量和精度。关键改进包括全局合并、使用实测仪器响应函数、采用柔性连接子以避免方向偏差,以及使用sfGFP以更好表征短寿命的Nrf2。受体水平被确认为变异性的主要来源,对其加以考量后提高了灵敏度和可重复性。该方法能稳健检测相互作用强度的细微变化。
研究不足
该方法可能因受体表达水平的细胞间差异而受到影响,且过表达系统可能无法完全反映内源性条件。活体成像过程中的光毒性和细胞运动对采集时间和激光功率构成限制。
1:实验设计与方法选择:
本研究采用改进的FLIM/FRET方法测量Nrf2-Keap1相互作用。构建了Keap1与mCherry间含柔性连接子的DNA载体,并选用sfGFP作为FRET供体以匹配Nrf2的短半衰期。数据分析采用全局分箱法,并测量仪器响应函数(IRF)以确保精度。
2:样本选择与数据来源:
培养HeLa和HEK293细胞并转染多种DNA载体(如EGFP-Nrf2、sfGFP-Nrf2、Keap1-mCherry突变体)。使用共聚焦显微镜和FLIM对活细胞进行成像。
3:sfGFP-NrfKeap1-mCherry突变体)。使用共聚焦显微镜和FLIM对活细胞进行成像。 实验设备与材料清单:
3. 实验设备与材料清单:蔡司LSM 710共聚焦显微镜、SPC-150时间相关单光子计数(TCSPC)???、相干公司Chameleon双光子激光器、HPM-100-40GaAsP探测器、FluoroDish细胞培养皿、脂质体2000转染试剂、磷酸钙转染法、免疫印迹设备(如BioRad ChemiDoc MP成像系统、Odyssey CLx成像系统)及多种抗体(抗Nrf2、抗EGFP、抗Keap1、抗β-肌动蛋白)。
4:抗EGFP、抗Keap抗β-肌动蛋白)。 实验流程与操作步骤:
4. 实验流程与操作步骤:细胞转染后进行荧光成像和FLIM测量。使用SPCImage软件结合全局分箱法和实测IRF分析荧光寿命数据,通过OMERO和Excel/R进行数据处理与统计分析。
5:数据分析方法:
在SPCImage中采用指数衰减模型(1或2组分)拟合荧光寿命数据。FRET效率计算公式为EFRET = 1 – tm/t2。统计分析包括Pearson相关性、线性回归、Wilcoxon秩和检验及Welch t检验(使用R或Excel完成)。
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